2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/India/MH-AFMC-5868/2020
序列号	EPI_ISL_496533
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-05-26
采样地点	India / Maharashtra
相关ID
谱系	B.1.1.101 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/2/13/Yes
样本提供单位	Armed Forces Medical College
数据递交单位	National Centre For Cell Science
发布时间	2020-07-25 03:25:33

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/India/AFMC_5868/2020 (EPI_ISL_496533)
SNP数目	11
Insertion数目	0
Deletion数目	3
Indel数目	0
相似度	99.95
质量评估分级	B2
注释统计	14(synonymous_variant:3; intergenic_variant:2; missense_variant:7; upstream_gene_variant:1; inframe_deletion:1)
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