2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/England/MILK-992152/2020
序列号	EPI_ISL_540650
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-08-27
采样地点	United Kingdom / England
相关ID	OX609594.1
谱系	B.1.1.240 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/13/Yes
样本提供单位	Queens Medical Centre, Clinical Microbiology Department / DeepSeq Nottingham
数据递交单位	COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium
发布时间	2020-09-22 04:28:07

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/England/MILK-992152/2020 (EPI_ISL_540650)
SNP数目	13
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.95
质量评估分级	B2
注释统计	15(synonymous_variant:3; intergenic_variant:2; missense_variant:9; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)