2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/England/MILK-A180DE/2020
序列号	EPI_ISL_595017
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-10-01
采样地点	United Kingdom / England
相关ID	OX472002.1,OY911909.1
谱系	B.1.1.240 (Version: )
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/16/Yes
样本提供单位	Northumbria University / South Tees Hospitals NHS Foundation Trust / North Cumbria Integrated Care NHS Foundation Trust / North Tees and Hartlepool NHS Foundation Trust / Newcastle Hospitals NHS Foundation Trust
数据递交单位	COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium
发布时间	2020-10-27 08:26:51

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/England/MILK-A180DE/2020 (EPI_ISL_595017)
SNP数目	16
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.94
质量评估分级	C
注释统计	18(synonymous_variant:4; intergenic_variant:2; missense_variant:11; upstream_gene_variant:1)
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