2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/England/C200037197/2020
序列号	EPI_ISL_636729
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-10-23
采样地点	United Kingdom / England
相关ID
谱系	B.1.1.240 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/21/Yes
样本提供单位	Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
数据递交单位	Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
发布时间	2020-11-14 14:21:55

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/England/C200037197/2020 (EPI_ISL_636729)
SNP数目	21
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.92
质量评估分级	C
注释统计	23(synonymous_variant:7; intergenic_variant:2; missense_variant:13; upstream_gene_variant:1)
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