2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Lithuania/LSMULKKGMMK32C18/2021
序列号	EPI_ISL_8702800
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-12-20
采样地点	Lithuania / Marijampoles
相关ID
谱系	AY.4.17 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/3/49/NO
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2022-01-16 20:26:22

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Lithuania/LSMULKKGMMK32C18/2021 (EPI_ISL_8702800)
SNP数目	46
Insertion数目	0
Deletion数目	3
Indel数目	0
相似度	99.84
质量评估分级	C
注释统计	49(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:8; intergenic_variant:1; missense_variant:33; upstream_gene_variant:4; inframe_deletion:2)
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