槟榔,属于棕榈科槟榔属常绿乔木。它在热带地区被广泛种植,在农业和工业方面有广泛的应用。槟榔为世界卫生组织国际癌症研究机构致癌物清单1类致癌物,被众多欧美国家禁售。槟榔果实会让人上瘾,经常嚼槟榔,除了严重损害牙齿,而且还有很高的致癌风险。
槟榔原产马来西亚,亚洲热带地区广泛栽培。槟榔树主要分布在东南亚、亚洲热带地区、东非及欧洲部分区域,太平洋地区主要分布在巴布亚新几内亚、所罗门群岛、斐济、瓦努阿图以及密克罗尼西亚,零星分布在皮纳佩岛、美属马里亚纳群岛和马绍尔群岛,夏威夷群岛槟榔种植仅用作观赏。
在中国,槟榔主要分布在云南、海南及台湾等热带地区。
2021年,中国热带农业科学院椰子研究所与深圳华大基因合作,成功完成槟榔基因组测序拼接及序列分析。该团队结合Illumina和PacBio数据以及Hi-C作图技术,生成了高质量的染色体水平层次的参考基因组。组装的基因组总长度为 2.51 Gb,scaffold N50为1.7 Mb。随后,scaffold进一步组装成16条假染色体,N50值为172 Mb。通过基因注释,槟榔基因组预测了31,571个蛋白编码基因。
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5.Yang Y, Huang L, Xu C, et al. Chromosome-scale genome assembly of areca palm (Areca catechu). Mol Ecol Resour. 2021;21(7):2504-2519. [OpenLBID: OLB-PM-34133844]
Data Statistics | |
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Taxonomy ID | 184783 |
Projects | - |
Samples | - |
Genomes | 1 |
Variations | - |
Expressions | - |
Reference | areca_palm_Reyan |
Refgenes | 31,569 |
Cultivars | 42 |