简介

甘蔗，禾本科甘蔗属草本植物，是温带和热带广泛种植的农作物。甘蔗是全世界热带糖料生产国的主要经济作物，尤其是东南亚太平洋诸岛国、大洋洲岛屿和古巴等地的经济支柱之一。甘蔗是我国制糖的主要原料，也是轻工、化工和能源的重要原料，具有极高的经济价值。

地理分布

甘蔗原产地可能是新几内亚或印度，后来传播到南洋群岛，大约在周朝周宣王时传入中国南方。先秦时代的“柘”就是甘蔗，到了汉代才出现“蔗”字，10到13世纪（宋代），江南各省已经普遍种植甘蔗。

全世界有一百多个国家出产甘蔗，最大的甘蔗生产国是巴西、印度和中国。种植面积较大的国家还有古巴、泰国、墨西哥、澳大利亚、美国等。中国蔗区主要分布在广西（产量占全国60%）、广东、台湾、福建等南方热带地区。

应用

• 食用：甘蔗中含有丰富的糖分、水分，此外，还含有对人体新陈代谢有益的各种维生素、脂肪、蛋白质、有机酸、钙、铁等物质。
• 保健：甘蔗味甘、性寒，归肺、胃经，具有清热解毒、生津止渴、和胃止呕、滋阴润燥等功效。
• 工业原料：甘蔗茎秆为重要的制糖原料，茎中汁液含蔗糖12%-15%，还原糖、淀粉、果胶、脂肪约占4%，蔗渣的纤维含量约12%，含糖分多，出糖率高，纤维少，质量好，产量高。秆梢与叶片除作为牛羊等家畜的好饲料外，还可供药用，制乙醇作为替代能源，养酵母以及作建筑材料等。

基因组测序

甘蔗品种AP85-441在福建农林大学的领导下完成测序。利用BAC文库、基于PE250技术的Hiseq 2500和PacBio RS II等技术，组装获得基因组大小为 3.13 Gbp，Contig N50为45 kb。同时基于 Hi-C 物理图谱将2.9 Gbp 的基因组序列锚定至32条染色体。 使用MAKER软件，总共注释了35,525个具有定义等位基因的基因，总共有 82,773 个等位基因，平均每个基因有2.3个等位基因。

S. spontaneum Np-X基因组由福建农林大学领导测序完成。测序获得了52Gb的PacBio CCS长读长数据和417Gb的Illumina短读长数据。使用Canu（v1.9）和Hi-C将 S. spontaneum Np-X的高质量同源多倍体基因组组装成跨10个同源组的40个假染色体，基因组大小为2.76Gb，contig N50为382Kb，注释蛋白编码基因122,441个。与之前的S. spontaneum AP85-441基因组结果相比有了很大的改进。

Reference

1.中国科学院中国植物志委员会. 中国植物志.第10卷[M]. 科学出版社,

2.Zhang J, Zhang X, Tang H, et al. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L. Nat Genet. 2018;50(11):1565-1573. [OpenLBID: OLB-PM-30297971]

3.Zhang Q, Qi Y, Pan H, et al. Genomic insights into the recent chromosome reduction of autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum. Nat Genet. 2022;54(6):885-896. [OpenLBID: OLB-PM-35654976]